隐匿性阴茎的治疗主要包括了观察等待和手术矫正,肥胖而隐匿性阴茎经减肥可明显改善,12-14岁以后,儿童体内雄激素水平逐渐提高,阴茎发育较快,阴茎外观变化较大,加之会阴部脂肪的重新分布,绝大多数小儿隐匿性阴茎,会随着年龄的增加而自愈。对于青春期以后仍无明显好转的隐匿性阴茎,可以行手术矫正,手术主要是切除阴茎肉膜层束缚阴茎的纤维束带组织,以及肥厚的阴阜脂肪垫,使阴茎完全松解,充分伸直,并将阴茎皮肤和筋膜固定的阴茎上以防退缩,因此隐匿性阴茎的手术治疗,建议是在青春期以后,在此之前主要是以观察等待为主。