1、静脉窦血栓和动脉血栓一样，如果时间窗允许在6个小时以内或10个小时以内可以进行溶栓治疗，这是静脉窦血栓和动脉窦血栓不同的地方，静脉窦血栓的实际溶栓窗可以适当的放宽。
2、静脉窦血栓可以必须用抗凝治疗，很多静脉窦血栓可以合并脑部的出血，但是一般来讲只要出血不是特别严重，即使有出血的状态下也要进行抗凝治疗，只有这样才能抑制血栓的发展，才能抑制功能损伤的发生。
另外对于严重的静脉窦血栓，可以采取外科的手术治疗，切除血栓对改善愈后有很大的帮助，此外静脉窦血栓往往何为合并癫痫发作，因此需要进行抗癫痫治疗，同时静脉窦血栓往往有严重的脑水肿，因此还要进行相应的激素治疗或者是脱水治疗。
