妇科囊肿包括很多种类型，最简单的滤泡囊肿和黄体囊肿为例，这两种生理性的囊肿可能不会伴有太多的不适的主诉。如果是另外的其他性质的囊肿，例如子宫内膜异位囊肿，子宫内膜异位症的一些常见的表现，患者最典型的症状就是继发性进行性的痛经。另外如果是由于炎性病变导致的囊肿，患者在慢性期可能会有慢性的盆腔疼痛、腰痛等表现，在急性期可能会有发热、腹痛、体温升高，包括血象升高等等的表现。
如果囊肿并发蒂扭转，患者典型的临床表现是在体位突然改变后出现的，急性的下腹痛，通常患者因为急腹症就诊到不同医院的急诊，完善了查体以及一些相关的检验检查之后，确定如果是卵巢囊肿蒂扭转的话，建议立刻进行腹腔镜下的探查术。如果是囊肿并发感染，就像刚才提到的可能会出现发热腹痛等表现。
另外如果囊肿出现了破裂，患者可能会出现全腹的压痛，腹肌紧张、反跳痛等腹膜刺激症状。
