细菌性腹泻是可以用抗生素治疗的感染性腹泻。针对不同细菌感染引起的腹泻用不同的抗生素是针对不同的细菌来用不同的消炎药，比如痢疾，一般都有抗痢疾的革兰氏阴性菌的抗生素，最常见的口服的小儿最常见的、副作用比较小的，比如黄连素，头孢，小儿细菌性腹泻常见的。
细菌性腹泻常用的药除了针对病因抗细菌感染之外，还有对症处理，比如大便比较多，食欲不太好，要给患者进行补液的治疗，要采取益生菌的治疗。因为细菌感染导致腹泻，不单造成腹泻次数的增多，还会造成小孩肠道菌群紊乱，所以给予相应的调理微生态的药，也就是益生菌的治疗，所以小孩细菌性腹泻主要的是用抗生素治疗加微生态的药物的治疗，同时注意给予口服补液的治疗，防止腹泻造成的体液的过分的丢失造成的脱水。
