细菌性的肝脓肿是一种继发性的感染性的病变，往往是由于胆道系统的一些疾病，比如临床上常见的化脓性的胆管炎症，这时候细菌可以通过胆道上行进入肝脏，在局部形成脓肿。也可以通过腹腔的一些常见感染，比如坏疽性的阑尾炎、化脓性的盆腔炎、急性肠胃炎时的细菌性痢疾等，这些细菌可以通过门静脉系统，其脓毒的栓子由血管壁脱落以后沿着门静脉系统进入肝脏，引起局部的肝脓肿。此外，还见到一些患者是由于一些肝脏邻近器官的化脓性的病变，比如急性化脓性的胆囊炎、膈下的脓肿、胃及十二指肠局部穿孔等，这时候细菌一方面通过淋巴系统转移到肝脏，引起肝脏的局部的感染，另外这些细菌还可以通过直接侵入肝脏引起肝脏的局部炎症。
总之，在临床上发现身体的任何部位的化脓性感染，甚至包括上呼吸道感染、皮肤局部的感染，甚至耳鼻喉的部位的感染，都可以引起肝脏的局部炎症，最终导致形成肝脓肿。
