进行锥切术通常是因为宫颈出现了高度病变，这类病变涵盖CIN2和CIN3，其中针对CIN3，一般建议实施锥切。锥切的主要目的是切除病变组织，同时也能去除大部分HPV病毒，不过，可能仍有少量病毒会残留在剩余的宫颈组织中。
HPV转阴往往需要半年到八个月，甚至更久的时间，所以一般不会在锥切术后很快进行HPV病毒检测。因此，若锥切术后HPV持续阳性不转阴，首先要考虑术后时间因素。如果术后才2 - 3个月，此时的处理方式就是耐心等待。
如果术后时间较长，HPV仍持续阳性，对于年轻患者，建议接种HPV疫苗；若存在反复感染的情况，可以尝试使用干扰素进行治疗，不过在治疗前需向患者明确说明，此类治疗仅为尝试性手段。
